馬拉松距離長，對於選手來說，隱藏看不見的風險，尤其容易被忽略的是可能發生血糖降低的現象，也可稱為「運動性低血糖症」，所以途中見需要補充糖份、水份、鹽分。甚至在終點站除需準備必要的飲料外，還應攝取一些水果、巧克力等食品，否則容易產生身體不適。
/>▲ 除了「運動性低血糖症」，馬拉松選手還可能出現小腿抽筋、運動性血尿等問題。
面對即將於17日開跑的2013國道馬拉松比賽，預計有1萬2千名參賽者共襄盛舉。台東基督教醫院家醫科黃信揚醫師表示，為了照顧參賽選手的健康，建議主辦單位能增加「血糖檢測站」，透過血糖測量，讓選手在賽前更能掌握身體狀況，安全又健康。
根據研究發現，運動超過30分鐘，肝臟與肌肉儲存的醣份即耗盡，往往會出現血糖過低的狀況，如飢餓、大量流汗、虛弱等不適。這種低血糖症也可稱為「運動性低血糖症」，運動性低血糖症一般發生在運動過程中或比賽結束後。
黃信揚醫師建議，運動超過半小時，最好能補充一份點心(15公克碳水化合物)來維持血糖值，適時補充水分以防脫水。即使是平時身體狀況不錯的人，賽前都需做足準備，更何況是糖尿病患者，若血糖低於100mg/dl，最好先休息並補充營養，直到血糖值穩定再繼續。
除了「運動性低血糖症」，馬拉松選手還可能出現以下風險問題：
【小腿抽筋】
運動員的肌肉長時間連續快速收縮，容易形成疲勞，造成抽筋現象。小腿抽筋時應立即停止運動，伸直膝關節、勾足尖，按摩小腿肌肉。按摩的方法是，用拇指捏揉小腿肚子中央(即承山穴)，即可使抽筋部位得到緩解，值得注意的是，按摩時不要用力過大過猛。
【 運動性血尿】
馬拉松比賽後，有些運動員可能出現肉眼或顯微鏡下血尿，大部分運動員出現血尿的持續時間短，一般在24小時內均恢復正常，最遲在36小時內恢復正常。一旦出現運動性血尿，首先應減小運動量，症狀能隨之逐漸減輕。如減小運動量後仍不消失，就應該停止訓練，進行必要的藥物治療，包括可注射安絡血、止血敏、三磷酸腺苷、輔酶A和維生素B12，口服維生素C、K等。
【運動性貧血】
在馬拉松訓練中，由於運動量過大，往往會造成紅血球的破壞和血紅蛋白的減少，從而造成一時性貧血，由運動引起的貧血稱之為運動性貧血。一般只要調整運動量、增加營養，尤其要增加含蛋白質、鐵質豐富的食物，例如綠色蔬菜、水果、各種瘦肉、肝臟、豆類、蛋類等，就可使運動員機能狀態恢復正常。
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